Основным направлением деятельности лаборатории является микробиологический контроль качества продукции (стерильность или микробиологическая чистота); определение антимикробного действия лекарственных средств; эффективности антимикробных консервантов; определение ростовых, селективных и диагностических свойств питательных сред с использованием тест-микроорганизмов; микробиологический мониторинг производственной среды.
Лаборатория имеет техническую базу, включающую необходимое испытательное оборудование и средства измерений, рабочие стандартные образцы, реактивы, стандартные питательные среды, рабочую коллекцию музейных культур (бактерии и грибы III-IV групп патогенности). Лаборатория лицензирована на осуществление деятельности в области использования микроорганизмов III и IV степени потенциальной опасности.